Ingénieur standardisation des données - h/f

Inserm

FRonsitePosted Jun 24, 2026
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Skills

jupyterpythonfhirant

About the role

Description entreprise :

L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.

Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.

L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.

Description du poste :

A propos de la Structure : Le poste est à pourvoir au sein de l’Unité mixte de service (UMS) France Cohortes, structure alliant expertise en Epidémiologie, Data Science, Système d’information, Interopérabilité, Collecte de données, Réglementation et Communication. Les cohortes épidémiologiques sont des enquêtes longitudinales visant à identifier les facteurs de survenue et d’évolution des maladies. Au cours du suivi de leurs participants volontaires, elles ont vocation à recueillir des données de nature extrêmement variée, incluant des données sensibles de santé, et potentiellement volumineuses. Notre mission : accompagner ces cohortes en leur offrant des services mutualisés, des outils innovants et des méthodes standardisées pour la production, la diffusion et l’exploitation de données essentielles à la recherche en santé publique.

Mission principale : Vous aurez pour rôle de formaliser la structure des données des cohortes pour en garantir l’interopérabilité et la réutilisation, en évaluant l’adéquation de standards (OMOP, FHIR, etc.) avec les typologies de données existantes (épidémiologiques, cliniques). Après identification du périmètre pertinent et de l'état de l'art, vous accompagnerez les équipes dans l’adoption de ces standards, notamment en développant des scripts pour transformer les données. Le cas échéant, vous créerez une bibliothèque d’outils réutilisables (statistiques, KPI, visualisation…). L'ensemble s'inscrit dans une organisation par projet sous la responsabilité du pôle technico-fonctionnel.

Activités principales :

Evaluer les standards de données en fonction de la typologie des données attendues sur France Cohortes

Développer les scripts nécessaires à la migration des données vers le format cible retenu

Evaluer les performances des requêtes effectuées sur le format cible

Evaluer avec les cohortes les outils de l'écosystème du standard retenu sur les données une fois migrées

Contribuer à la stratégie des tests et à la recette de la solution retenue

Contribuer à enrichir l'écosystème du standard retenu (scripts/outils)

Mettre en place une offre de formation à l’utilisation du format retenu et des outils en direction des équipes de production des données des cohortes

Spécificité(s) et environnement du poste : Les données traitées sont strictement confidentielles

Poste basé rue Albert,75013 Paris

Profil recherché :

Connaissances :

Connaissance de standards de données orientés santé (OMOP, FHIR)

Connaissance d'un framework de tests

Connaissance de langages/outils pour les statistiques (R,Jupyter)

Connaissance des Webservices et solutions de gestion d’API

Maitrise du langage python

Maitrise du langage SQL

Svoir-faire :

Maîtrise de l’utilisation de formats de fichiers (csv, parquet)

Maitrise de GIT

Rédaction de documentation technique et méthodologique (rapport),

Coordination de projet et management transversal d’un réseau de compétences,

Capacité à travailler en anglais : niveau B2 CECRL souhaité

Aptitudes :

Aisance relationnelle, sens de la communication et de la pédagogie

Capacités d’organisation, de planification et de rigueur

Discrétion et confidentialité

Capacité à fédérer et à convaincre

Capacité d’adaptation et de curiosité

Niveau de diplôme et formation(s) :

Titre ou diplôme classé au moins au niveau 6

Formation supérieure de type Master 2 en data science ou en informatique

Expérience(s) souhaité(s) : Une expérience sur tout ou partie des activités décrites précédemment, en particulier sur les phases de conception et de développement de projets en Data Management est souhaitée. Une formation complémentaire à l’utilisation des outils installés sur France Cohortes sera être proposée à la personne recrutée.

Avantages :

Congés Annuels et RTT : 32 jours de congés + 13 jours de RTT pour une année civile (hors déduction de la journée de solidarité)

Activités télétravaillables : 2 à 3 jours par semaine maximum sur accord du responsable hiérarchique.

Restauration collective subventionnée sur place

Comité d'action sociale (prestations sociales, culturelles, sportives)

Transports publics remboursés partiellement

Mutuelle santé collective obligatoire avec participation de l'employeur à hauteur de 50 % pour le socle de base et à hauteur de 50 % dans la limite de 5 € pour les options

Prévoyance collective facultative avec participation de l'employeur à hauteur 7 € pour le socle de base

Pour en savoir + :

Sur l'Inserm : https://www.inserm.fr/ ; site RH : https://rh.inserm.fr/Pages/default.aspx

Sur France Cohortes : https://francecohortes.org

Questions about this role

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